MethMarker: User-friendly design and optimization of gene-specific DNA methylation assays

Peter Schüffler, Thomas Mikeska, Andreas Waha, Thomas Lengauer, Christoph Bock

Publikation: Beitrag in FachzeitschriftArtikelBegutachtung

24 Zitate (Scopus)

Abstract

DNA methylation is a key mechanism of epigenetic regulation that is frequently altered in diseases such as cancer. To confirm the biological or clinical relevance of such changes, gene-specific DNA methylation changes need to be validated in multiple samples. We have developed the MethMarker http://methmarker.mpi-inf.mpg.de/ software to help design robust and cost-efficient DNA methylation assays for six widely used methods. Furthermore, MethMarker implements a bioinformatic workflow for transforming disease-specific differentially methylated genomic regions into robust clinical biomarkers.

OriginalspracheEnglisch
Aufsatznummer105
FachzeitschriftGenome Biology
Jahrgang10
Ausgabenummer10
DOIs
PublikationsstatusVeröffentlicht - 5 Okt. 2009
Extern publiziertJa

Fingerprint

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