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Übersichtsartikel

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  • 2024

    Rescoring Peptide Spectrum Matches: Boosting Proteomics Performance by Integrating Peptide Property Predictors Into Peptide Identification

    Kalhor, M., Lapin, J., Picciani, M. & Wilhelm, M., 1 Juli 2024, in: Molecular and Cellular Proteomics. 23, 7, S. 100798 1 S.

    Publikation: Beitrag in FachzeitschriftÜbersichtsartikelBegutachtung

    Open Access
    3 Zitate (Scopus)
  • 2023

    Toward an Integrated Machine Learning Model of a Proteomics Experiment

    Neely, B. A., Dorfer, V., Martens, L., Bludau, I., Bouwmeester, R., Degroeve, S., Deutsch, E. W., Gessulat, S., Käll, L., Palczynski, P., Payne, S. H., Rehfeldt, T. G., Schmidt, T., Schwämmle, V., Uszkoreit, J., Vizcaíno, J. A., Wilhelm, M. & Palmblad, M., 3 März 2023, in: Journal of Proteome Research. 22, 3, S. 681-696 16 S.

    Publikation: Beitrag in FachzeitschriftÜbersichtsartikelBegutachtung

    Open Access
    30 Zitate (Scopus)
  • 2021

    A proteomics sample metadata representation for multiomics integration and big data analysis

    Dai, C., Füllgrabe, A., Pfeuffer, J., Solovyeva, E. M., Deng, J., Moreno, P., Kamatchinathan, S., Kundu, D. J., George, N., Fexova, S., Grüning, B., Föll, M. C., Griss, J., Vaudel, M., Audain, E., Locard-Paulet, M., Turewicz, M., Eisenacher, M., Uszkoreit, J. & Van Den Bossche, T. &20 mehr, Schwämmle, V., Webel, H., Schulze, S., Bouyssié, D., Jayaram, S., Duggineni, V. K., Samaras, P., Wilhelm, M., Choi, M., Wang, M., Kohlbacher, O., Brazma, A., Papatheodorou, I., Bandeira, N., Deutsch, E. W., Vizcaíno, J. A., Bai, M., Sachsenberg, T., Levitsky, L. I. & Perez-Riverol, Y., 1 Dez. 2021, in: Nature Communications. 12, 1, 5854.

    Publikation: Beitrag in FachzeitschriftÜbersichtsartikelBegutachtung

    Open Access
    52 Zitate (Scopus)
  • The emerging landscape of single-molecule protein sequencing technologies

    Alfaro, J. A., Bohländer, P., Dai, M., Filius, M., Howard, C. J., van Kooten, X. F., Ohayon, S., Pomorski, A., Schmid, S., Aksimentiev, A., Anslyn, E. V., Bedran, G., Cao, C., Chinappi, M., Coyaud, E., Dekker, C., Dittmar, G., Drachman, N., Eelkema, R. & Goodlett, D. &23 mehr, Hentz, S., Kalathiya, U., Kelleher, N. L., Kelly, R. T., Kelman, Z., Kim, S. H., Kuster, B., Rodriguez-Larrea, D., Lindsay, S., Maglia, G., Marcotte, E. M., Marino, J. P., Masselon, C., Mayer, M., Samaras, P., Sarthak, K., Sepiashvili, L., Stein, D., Wanunu, M., Wilhelm, M., Yin, P., Meller, A. & Joo, C., Juni 2021, in: Nature Methods. 18, 6, S. 604-617 14 S.

    Publikation: Beitrag in FachzeitschriftÜbersichtsartikelBegutachtung

    Open Access
    221 Zitate (Scopus)
  • 2018

    Expanding the Use of Spectral Libraries in Proteomics

    Deutsch, E. W., Perez-Riverol, Y., Chalkley, R. J., Wilhelm, M., Tate, S., Sachsenberg, T., Walzer, M., Käll, L., Delanghe, B., Böcker, S., Schymanski, E. L., Wilmes, P., Dorfer, V., Kuster, B., Volders, P. J., Jehmlich, N., Vissers, J. P. C., Wolan, D. W., Wang, A. Y. & Mendoza, L. &10 mehr, Shofstahl, J., Dowsey, A. W., Griss, J., Salek, R. M., Neumann, S., Binz, P. A., Lam, H., Vizcaíno, J. A., Bandeira, N. & Röst, H., 7 Dez. 2018, in: Journal of Proteome Research. 17, 12, S. 4051-4060 10 S.

    Publikation: Beitrag in FachzeitschriftÜbersichtsartikelBegutachtung

    Open Access
    49 Zitate (Scopus)